De la epoca neolitică și până în prezent, orașele importante prosperă la granițele municipiului Alexandroupolis, iar regiunea dezvoltă o cultură unică.
Locul locuit de vechii Cicones, unde se găsesc toate tipurile obișnuite de monumente megalitice (acropole fortificate, sanctuare în aer liber pentru cultul soarelui și al stelelor, picturi rupestre antropomorfe), a fost ulterior colonizat de coloniștii din Samothrace, care au fondat Peraea samothraciană, cu orașe importante precum Mésèmbria, Zona și Salé.
Orașul Salé corespunde Alexandroupolisului de astăzi, iar în perioada romană, regiunea era un loc de staționare și schimb de cai. Orașul vechiului Doriskos a fost un nod strategic pentru armatele lui Darius, Xerxes, Filip și Alexandru, conectând Asia cu restul Greciei. Doriskos este menționat chiar și în primii ani ai Imperiului Roman. Se crede că împăratul roman Traian, jefuindu-l, l-a distrus pentru a crea Traianopolis, noul oraș dominant. Organizarea rețelei de drumuri a Via Egnatia oferă oportunitatea pentru orașe importante (Traianopolis, Vira, Makri) și complexe mănăstirești (Panagia Kosmosotira la Feres, templul Sfinților Teodori), protejate de puternice instalații militare (castelele Potamos sau Avanta), să prospere în perioada bizantină. Regiunea joacă un rol important, deoarece este vecină directă a Constantinopolului.
Din motive care nu au fost încă clarificate, orașele Salé, Zona, Drusa și Serreio au fost distruse la un moment dat, nivelate și șterse din scrierile de descrieri. Locul a devenit o pădure interminabilă, în principal de stejari. Această pădure, pe care localnicii din zonele înconjurătoare o numeau Dede-Agach, era administrată de trei feudali turci care aveau mii de acri pentru culturi și pășuni.
După războiul ruso-turc, pescarii din Aïnos, Makri și Maronia au format o mică așezare, viitoarea Alexandroupolis, care a crescut treptat și s-a dezvoltat rapid odată cu construcția căii ferate. Așezarea a început în anii 1850, iar în deceniile următoare, odată cu sosirea rușilor, s-a conceput un plan urban pentru zona de coastă, de la bulevardul principal la mare.
În timpul războaielor balcanice, Dedeagach a trecut din mâinile otomanilor în mâinile bulgarilor, dar după tratatul de la Neuilly și o administrație interaliată temporară, regiunea a fost încorporată în Grecia la 14 mai 1920. După catastrofa din Asia Mică și schimbul de populații, mulți refugiați din Tracia de Nord (Tracia de Est), Tracia de Est și Asia Mică au găsit adăpost în regiune. În timpul celui de-al Doilea Război Mondial, Alexandroupolis a fost sub ocupație bulgară timp de 3 ani (1941-1944). Sfârșitul războiului a marcat începutul dezvoltării economice, demografice și culturale a orașului.
Astăzi, Alexandroupolis cunoaște o dezvoltare economică rapidă, cu drumul Egnatia, aeroportul, portul și stația de cale ferată ca motoare, și oferă o calitate ridicată a vieții, cu un echilibru ecologic și o activitate culturală intensă. În 2011, conform programului "Kallikratis", fostele municipalități Alexandroupolis, Traianopolis și Feres au fost unite pentru a crea noua municipalitate Alexandroupolis, cu o suprafață de 1.217 kilometri pătrați, cu sediul în Alexandroupolis și având Feres-ul ca sediu istoric.
