Von der neolithischen Zeit bis heute blühen bedeutende Städte innerhalb der Grenzen der Gemeinde Alexandroupolis, und die Region entwickelt eine einzigartige Kultur.

Der Ort, an dem die antiken Cicones lebten, wo alle gängigen Arten von megalithischen Denkmälern zu finden sind (befestigte Akropolen, Freiluftheiligtümer für die Verehrung von Sonne und Sternen, anthropomorphe Felszeichnungen), wird später von Kolonisten aus Samothrake besiedelt, die Samothrakische Perai gründen, mit bedeutenden Städten wie Mesembria, Zone und Sali.

Die Stadt Sali entspricht dem heutigen Alexandroupolis, und in römischer Zeit diente die Gegend als Park- und Pferdewechselplatz. Die Stadt des antiken Doriscus war ein strategischer Knotenpunkt für die Armeen von Dareios, Xerxes, Philipp und Alexander und verband Asien mit dem Rest Griechenlands. Doriscus wird sogar in den ersten Jahren des Römischen Reiches erwähnt. Es wird vermutet, dass der römische Kaiser Trajan, indem er plünderte, sie zerstörte, um Traianopolis, die neue dominierende Stadt, zu schaffen. Die Organisation des Straßennetzes des Egnatian Way bietet die Möglichkeit, dass bedeutende Städte (Traianopolis, Vira, Makri) und Klosterkomplexe (Panagia Kosmosotira in Feres, der Höhlentempel der Heiligen Theodoren), geschützt durch mächtige Militäranlagen (Burgen von Potamos oder Avanta), während der Byzantinischen Zeit blühen. Die Region spielt eine bedeutende Rolle, da sie unmittelbarer Nachbar von Konstantinopel ist.

Aus Gründen, die noch nicht geklärt sind, wurden die Städte Sali, Zone, Druis und Serreio zu einem bestimmten Zeitpunkt zerstört, eingeebnet und aus den schriftlichen Aufzeichnungen von Beschreibungen getilgt. Der Ort wurde zu einem endlosen Wald, hauptsächlich aus Eichen. Dieser Wald, den die Einheimischen aus den umliegenden Gebieten Dede-Agach nannten, wurde von drei türkischen Feudalherren verwaltet, die Tausende von Morgen Land für den Anbau und die Beweidung hatten.

Nach dem Russisch-Türkischen Krieg bildeten Fischer aus Ainos, Makri und Maroneia eine kleine Siedlung - das zukünftige Alexandroupolis -, die sich allmählich entwickelte und sich mit der Gründung des Bahnhofs rasch entwickelte. Die Besiedlung begann in den 1850er Jahren, und in den folgenden Jahrzehnten wurde mit der Ankunft der Russen ein Stadtplan für den Küstenbereich, von der zentralen Allee bis zum Meer, erstellt.

Während der Balkankriege wechselte Dedeagach von den Händen der Osmanen zu den Bulgaren, aber nach dem Vertrag von Neuilly und einer vorübergehenden interalliierten Verwaltung wurde das Gebiet am 14. Mai 1920 in Griechenland eingegliedert. Nach der Katastrophe von Kleinasien und dem Bevölkerungsaustausch suchten viele Flüchtlinge aus Nordthrakien (Ostthrakien), Ostthrakien und Kleinasien Zuflucht in der Region. Während des Zweiten Weltkriegs blieb Alexandroupolis 3 Jahre lang unter bulgarischer Besatzung (1941-1944). Das Ende des Krieges markierte den Beginn der wirtschaftlichen, demografischen und kulturellen Entwicklung der Stadt.

Heute erlebt Alexandroupolis eine schnelle wirtschaftliche Entwicklung mit der Egnatia Odos, dem Flughafen, dem Hafen und dem Bahnhof als treibenden Kräften und bietet eine hohe Lebensqualität mit Umweltbilanz und intensiver kultureller Aktivität. Im Jahr 2011 wurden gemäß dem "Kallikratis"-Programm die ehemaligen Gemeinden Alexandroupolis, Traianoupolis und Feres zusammengelegt und die neue Gemeinde Alexandroupolis mit einer Fläche von 1.217 Quadratkilometern gegründet, mit Sitz in Alexandroupolis und historischem Sitz in Feres.